La solution démontre des capacités avec dix millions de cellules et plus de 1 000 échantillons en une seule expérience
SEATTLE–(BUSINESS WIRE)–Parse Biosciences, l’un des principaux fournisseurs de solutions de séquençage unicellulaire accessibles et évolutives, annonce ce jour le lancement de Parse GigaLab™ qui permet d’étendre le séquençage unicellulaire à des milliards de cellules par an. Le GigaLab tire parti de la technologie unicellulaire Evercode™ de Parse avec un flux de travail élargi et une automatisation étendue pour permettre des découvertes jamais jugées possibles avec les approches unicellulaires actuelles.
Le GigaLab a été construit spécifiquement pour les chercheurs qui s’adaptent à des projets de dix millions de cellules et beaucoup plus. La capacité actuelle permet le profilage de 2,5 milliards de cellules par an et continuera de croître rapidement au fil du temps. Plusieurs premiers projets en cours au GigaLab devraient déjà dépasser le nombre total de cellules disponibles dans tous les ensembles de données unicellulaires publics à ce jour. Ces nouvelles capacités permettront aux chercheurs axés sur les médicaments et les écrans de perturbations à grande échelle, la génération d’ensembles de données pour les modèles d’IA générative et l’atlasage pour les études de population.
En tant que première démonstration en partenariat avec Ultima Genomics, le développeur d’une nouvelle plateforme révolutionnaire de séquençage de nouvelle génération à très haut rendement, Parse a réalisé la première expérience de dix millions de cellules avec 1 092 échantillons en une seule expérience, tout le codage à barres et la préparation de la bibliothèque ne prenant que trois jours. Cette première étude du genre a mesuré 90 perturbations cytokiniques dans 18 types de cellules immunitaires chez 12 donneurs de PBMC, ce qui a entraîné plus de 19 000 perturbations observées. Outre leur partenariat avec Ultima, l’équipe de Parse a collaboré avec le professeur Fabian Theis de Helmholtz Munich, dont le laboratoire a développé l’outil de biologie computationnelle unicellulaire, Scanpy. Theis et son laboratoire analysent cet ensemble de données de dix millions de cellules et l’utilisent pour former de nouveaux modèles d’IA.
« Les ensembles de données de perturbation unicellulaire à grande échelle sont exactement ce dont le domaine a besoin pour construire et former des modèles afin de nous aider à mieux prédire les résultats en matière de santé et de maladie », déclare Dr Theis. Et d’ajouter : « La rapidité et l’échelle avec lesquelles Parse est en mesure de fournir ces ensembles de données sont vraiment incroyables et accéléreront le rythme des découvertes. »
« Avec les kits de Parse, les chercheurs établissent désormais le profil d’un million de cellules ou de noyaux en une seule expérience », déclare Charlie Roco, PhD, directeur de la technologie et cofondateur de Parse Biosciences. « Nous n’avons toujours pas trouvé de limite à la technologie Evercode, et maintenant, avec le GigaLab, nous allons inaugurer une nouvelle ère d’analyse unicellulaire et redéfinir ce qui est possible pour améliorer la découverte biologique et la santé humaine. »
Les membres de l’équipe de Parse dévoileront des détails supplémentaires sur les capacités du GigaLab lors de la prochaine conférence de l’American Society of Human Genetics (ASHG) lors de la discussion CoLab Theater (Théâtre 1) le 6 novembre à 14h30 heure locale et durant toute la conférence au stand n° 703.
À propos de Parse Biosciences
Parse Biosciences est une entreprise mondiale dans les sciences du vivant ayant pour mission d’accélérer les progrès de la santé humaine et de la recherche scientifique. Permettant aux chercheurs d’effectuer le séquençage unicellulaire avec une facilité et une ampleur inégalée, son approche novatrice a permis des découvertes révolutionnaires dans le traitement du cancer, la réparation tissulaire, le traitement par cellules souches, les maladies rénales et hépatiques, le développement cérébral et le système immunitaire.
Grâce à la technologie développée à l’Université de Washington par les cofondateurs Alex Rosenberg et Charles Roco, Parse a levé plus de 100 millions de dollars en capital et est maintenant utilisé par plus de 2 000 clients à travers le monde. Son portefeuille croissant de produits comprend Evercode™ Whole Transcriptome, Evercode™ TCR, Evercode™ BCR, Gene Select et une solution d’analyse de données, Trailmaker™.
Parse Biosciences est basé dans le quartier animé de South Lake Union à Seattle, où la société a récemment établi son nouveau siège et ouvert un laboratoire de pointe. Pour en savoir plus, rendez-vous sur le site https://www.parsebiosciences.com/.
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